Phase-46 : Là où se retirent les Esprits

Tout commence avec un résumé de la phase précédente : Kira apprend par Raw Le Creuset qu'il est le Coordinateur Suprême, puis au tour de Mu d'apprendre que Raw n'est autre que le clone de son père, et enfin la bataille qui recommence à nouveau, et enfin Raw qui annonce à tous les vaisseaux qu'il va leur rendre un prisonnier qui se trouvait sur le Vesalius.
La bataille continue de faire rage entre l'Archangel et le Dominion. Asran et Kira se sont à nouveau unis pour affronter Clotho, Shani et Orga. Sur le Vesalius, Yzak est envoyé à bord du Duel, suivi de Raw à bord du CiGUE qui ordonne à son équipage d'envoyer la capsule de survie une fois qu'il a décollé.

Sur l'Archangel, la présence des MS de ZAFT est rapidement remarquée. La capsule de survie où se trouve Flay est envoyée, et la jeune fille est encore plus paniquée. Les vaisseaux de classe Nasca ont pour cible l'Eternal. Andrew est en colère de voir Le Creuset ici. Kisaka décide donc d'allier le Kusanagi à l'Eternal pour affronter ZAFT, pendant que l'Archangel s'occupe du Dominion.
Cagalli envoie alors les Astray se battre contre les Ginns. Yzak, quant à lui, approche du front, tout en pensant à sa dernière rencontre avec Dearka. Ce dernier le voit d'ailleurs arriver.
Le Vesalius envoie son attaque sur l'Eternal, mais le vaisseau se défend avec le Kusanagi. Pendant ce temps, Flay est toujours dans sa capsule de survie, au milieu de nul part. Mais sa présence est remarquée sur le Dominion. Natale se demande pourquoi ZAFT a-t-il envoyé soudain cette capsule. Asrael lui demande alors si elle compte la récupérer ou alors la détruire. Mais la jeune femme doit encore affronter l'Archangel. Murta Asrael se demande alors s'il y a bien un prisonnier à bord de la capsule.

Par ailleurs, Kira et Asran, toujours en SEED, commencent à perdre l'avantage face à leurs trois ennemis. Mais Kira ne réagit plus, Asran se fait donc encercler, mais heureusement Kira se resaisit et attaque le Calamity qu'il parvient à endommager. Mais le jeune garçon est toujours autant essouflé.
Alors que Mayura, à bord de son Astray, fait de son mieux pour détruire un Ginn, Yzak s'approche d'elle mais il se fait stopper par un tir du Buster. Les deux amis, maintenant ennemis, se font face...
La bataille continue d'éclater, mais tous doutent sur leur victoire ou leur défaite. L'Eternal et le Kusanagi continuent de combattre les trois vaisseaux de classe Nasca. Et plus loin du front, Flay toujours paniquée, tente d'entrer en contact avec l'Archangel.
Sur l'Eternal, Lacus demande à Andrew de s'allier au Kusanagi pour repousser le Vesalius et pouvoir s'échapper de ce face-à-face en passant entre les deux autres vaisseaux. Andrew en informe alors Maryu, qui vient d'être rejoint par Mu. Andrew leur explique qu'ils vont passer entre les vaisseaux de classe Nasca pour pouvoir échapper à une poursuite. Il demande ensuite à l'Archangel de s'occuper du Dominion.

Mais soudain, Flay parvient à utiliser la radio et crie le nom de l'Archangel. Tous les combats s'arrêtent, tous se demandent d'où vient cette voix, mais sur l'Archangel, on a immédiatement reconnu Flay Alstar. Mais le plus troublé est Kira. Sur le Dominion, Asrael se demande d'où vient cette voix. Flay crie alors dans la radio pour l'Archangel, elle se présente, elle appelle Miriallia, Sai, etc... Tous apprennent alors que ces paroles viennent de la capsule de survie. Cette situation fait sourire Raw...
Néanmoins, Kira reste encore le plus troublé, il n'en croit pas ses oreilles. Il repense alors à sa dernière rencontre avec Flay, lorsqu'elle voulait lui parler, mais qu'il n'avait pas le temps et qui ne se sont depuis plus revus. Kira perd alors tous ses moyens, il se fait attaquer par le Raider, alors que Asran tente de le secouer.
Sur le Dominion, Asrael demande si Flay est bien la fille de l'ancien ministre Alstar, ce que Natale confirme, puis elle demande à Orga de récupérer la capsule de survie. Asran continue désespérement d'interpeller Kira.

Mais une nouvelle fois, Flay sème le trouble lorsqu'elle crie dans la radio qu'elle possède la clé qui mettra fin à la guerre. Alors que Orga se dirige vers la capsule, Kira se reprend en main et fonce droit vers elle, mais le Calamity a de l'avance. Asran tente de rappeler Kira, mais le Freedom se fait attaquer et gravement endommager par le Forbidden et le Raider. Tous s'inquiètent alors pour Kira.
Asrael trouve étranges les paroles de Flay et se demande quelle est cette clé. Alors que la capsule de survie est attrapée par le Calamity, Natale se demande si ces paroles sont vraies, mais Asrael veut en avoir le coeur net.
L'Eternal et le Kusanagi se sont alliés pour percer la ligne de défense des vaisseaux Nasca. Andrew demande alors de l'aide à Maryu, mais cette dernière est aussi troublée par la présence de Flay. Alors Mu la rassure que la jeune fille a été récupérée par le Dominion. Maryu envoie alors les fusées de rappel.

Mais par ailleurs, Kira fait tout pour entrer en contact avec la capsule de survie, et il y parvient. Tous sont à nouveau étonnés, notamment Natale qui croyait que Kira était mort depuis un moment. Mais la plus surprise reste Flay, qui, tellement touchée d'entendre la voix de Kira qu'elle croyait elle aussi mort, se met à pleurer.
Cependant, le Freedom se fait attaquer par le Raider. Asran vient alors au secours de Kira et le resaisit en lui disant qu'il ne peut battre aucun ennemi avec son état actuel. Alors que le Forbidden va pour les attaquer, le Justice attrape le Freedom et bat en retraite, couverts par le Buster de Dearka. Kira, en pleur, explique à Asran que la fille à bord de la capsule était une personne qu'il a blessé et qu'il devait protégé. Et Flay, en voyant le Freedom s'éloigner, crie le nom de Kira. Le Calamity arrive alors sur le Dominion.
Alors que le Vesalius est gravement endommagé par le Kusanagi et l'Eternal, Maryu ordonne à l'Archangel de couvrir le Justice et le Freedom qui sont attaqués par le Forbidden.

Puis, par la suite, le Kusanagi et l'Eternal, suivi de l'Archangel, passent entre les deux vaisseaux de classe Nasca. Le Vesalius qui se trouvait au milieu explose alors avec le Capitaine et son équipage à son bord. Asran et Dearka saluent alors leur ancien capitaine mort au combat. Yzak, encore sous le choc, reçoit l'ordre par Raw de se replier pour le moment. Le Dominion fait de même et bat en retraite.
Par la suite, Flay est emmenée au poste de commandement du Dominion. Asrael lui demande alors quelle est cette clé et Flay lui remet la disquette. Il lui demande alors qui le lui a donné, et Flay répond que c'est le Commandant Le Creuset, celui qui porte un masque... Asrael, pensif, quitte la salle.
Natale se lève alors de son siège et regarde Flay. Cette dernière, en la voyant, n'en croit pas ses yeux. Natale s'approche et lui demande si elle va bien. Flay se met alors à pleurer et se jette dans les bras de Natale.
Cependant, Asrael est retourné dans sa chambre et a entré dans son ordinateur la disquette que lui a remis Flay. Il voit alors le plan détaillé du Freedom et du Justice, et il apprend donc qu'ils possèdent des moteurs nucléaires N-Jammer Canceler. Cette nouvelle semble énormément réjouir Asrael...

Asran et Kira sont sur l'Eternal. Asran aide alors son ami à s'asseoir et lui demande s'il va bien. Kira, qui semble exténué, s'excuse. Lacus les rejoint alors et se penche face à Kira. Mais ce dernier, en regardant le visage de la chanteuse, voit apparaître celui de Flay... Kira s'excuse alors à nouveau, puis il s'évanouit.
Plus tard, Maryu a rejoint Mu qui est allongé sur un lit, toujours blessé. La jeune femme lui apprend alors que Kira est effondré, et que ça ne semble pas être à cause du combat, mais plutot la réapparition soudaine de Flay. Mu pense que tout cela doit lui peser. Maryu ouvre alors un livre qui se trouvait à côté de l'homme. Il s'agit d'un album photo. Mu explique alors à Maryu que son père était un homme arrogant, puis il se demande comment il a pu changer autant. Il se rappelle alors de Raw Le Creuset, puis il dit à Maryu que ce dernier n'est qu'une expérience ratée et que son processus de vieillissement est accéléré. Mais Maryu le rassure alors, elle lui dit que ce n'est pas de sa faute.
Mu continue en disant que Raw n'a ni passé, ni futur. Il se rappelle alors lorsque ce dernier lui a dit qu'il ouvrirait la dernière porte qui mettrait fin à l'humanité. Mais Mu jure de ne pas laisser Raw réussir.

Cagalli a rejoint l'Eternal, dans la chambre où se trouve Kira, accompagné de Lacus et Asran. Elle tombe alors sur le cadre où se trouve la même photo que lui a donné son père. Elle sort alors la sienne et les compare, elle ne comprend pas ce qu'il se passe, elle reste troublée.
Mais Kira se réveille alors, et à nouveau en voyant Lacus, il se rappelle Flay lorsqu'il avait couché avec cette dernière. Il reprend alors ses esprits, puis il s'excuse à nouveau. Cagalli l'appelle et lui montre les deux photos. Le jeune garçon baisse alors la tête et se retient de pleurer. Asran, en voyant ça, attrape Cagalli et la fait sortir de la chambre avec lui.
Face à la chambre, Asran explique à Cagalli que Kira a besoin d'être seul. Il demande ensuite à la jeune fille si elle savait qui était la personne qui appelait dans la capsule de survie. Cagalli explique alors qu'il s'agissait de Flay, la petite amie de Kira et une des amies de l'équipage de l'Archangel. Asran semble alors comprendre. Puis un long flash-back sur Flay a lieu.

On retrouve alors Lacus et Kira. La jeune fille lui demande si tout va bien, mais Kira lui dit qu'il ne veut plus jamais pleurer. Par ailleurs, Miriallia a rejoint Dearka dans le réfectoire. Lacus explique alors à Kira que c'est bien de pleurer si on en a besoin. Kira la regarde alors, et tombe en larme dans les bras de Lacus.
Alors que Erika Simmons, à bord du Kusanagi, s'occupe de la maintenance du Strike Rouge, une nouvelle unité, et que tous les personnages, de chaque camps semblent exténués, Lacus explique à Kira que c'est la personne qu'il est actuellement qui compte.
Asran est toujours avec Cagalli et lui dit que tout le monde pleure maintenant. Cagalli pause alors sa tête sur son épaule, et c'est sur la tristesse que peuvent resentir chaque personnage que se termine l'épisode...

Le grand retour de Flay dans l'esprit et le coeur de Kira, qui n'a tout compte fait jamais pu l'oublier. Ce tragique destin de ces deux personnages affectent ainsi tous les protagonistes, épuisés par ces combats et ces événements.